Основными методами скрещивания являются: поглощающий, вводный или прилития крови, промышленный и переменный.
Применяя поглощающее скрещивание, заменяют низкопродуктивную породу пчел на высокопроизводительную культурную. Однако, необходимо убедиться в хорошей акклиматизации породы-улучшителя к местным условиям. При этом методе скрещивания самок заменяемой породы, а затем самок-помесей I-IV поколений спаривают с чистопородными трутнями поглощающей породы. Самцов-помесей для племенных целей не используют. Как уже отмечалось, обеспечив пространственную изоляцию, можно легко заменить одну породу пчел на другую, применив прием двукратной замены маток.