Доказано, что неквалифицированное проведение термообработки губительно действует не только на клеща варроа Якобсон, но и на пчел. Основная причина этого — перегрев пчел, насыщения камеры водяным паром, нарушение процесса дыхания, отравление пчел продуктами обмена. Вредное влияние термообработки можно минимизировать, если ее проводить при
достижении температуры в камере 46 °С не более 10-12 мин,
относительная влажность воздуха при этом в термокамере не должна превышать 30-40%. При термообработке должен быть обеспечен неограниченный приток свежего воздуха в камеру. Исследованиями также установлено, что нежелательно проводить термообработку пчел после длительных периодов с низкой внешней температурой. Это объясняется тем, что при таком условии возрастает концентрация углекислого газа в гнезде, а это приводит к сокращению продолжительности жизни пчел в результате действия высоких температур (в термокамере).